Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Edn3P48299 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms