Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VdrP48281 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VdrP48281 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VdrP48281 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VdrP48281 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VdrP48281 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VdrP48281 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VdrP48281 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VdrP48281 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VdrP48281 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VdrP48281 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VdrP48281 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VdrP48281 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VdrP48281 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VdrP48281 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VdrP48281 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VdrP48281 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VdrP48281 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VdrP48281 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VdrP48281 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VdrP48281 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VdrP48281 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VdrP48281 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VdrP48281 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VdrP48281 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VdrP48281 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VdrP48281 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VdrP48281 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms