Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf4P43488 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf4P43488 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms