Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Chd1P40201 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd1P40201 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd1P40201 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd1P40201 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chd1P40201 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chd1P40201 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chd1P40201 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd1P40201 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd1P40201 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd1P40201 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd1P40201 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chd1P40201 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd1P40201 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd1P40201 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms