Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Flt1P35969 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flt1P35969 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Flt1P35969 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flt1P35969 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flt1P35969 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Flt1P35969 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Flt1P35969 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Flt1P35969 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Flt1P35969 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Flt1P35969 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Flt1P35969 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms