Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rfc1P35601 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rfc1P35601 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms