Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab5cP35278 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab5cP35278 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms