Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3dP35276 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3dP35276 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms