Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp4P35123 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp4P35123 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp4P35123 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp4P35123 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp4P35123 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp4P35123 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp4P35123 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp4P35123 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp4P35123 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp4P35123 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp4P35123 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp4P35123 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp4P35123 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp4P35123 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp4P35123 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms