Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoc1P34928 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoc1P34928 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms