Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifnar1P33896 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifnar1P33896 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms