Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PrkcdP28867 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PrkcdP28867 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms