Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BgnP28653 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BgnP28653 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BgnP28653 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BgnP28653 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BgnP28653 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BgnP28653 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BgnP28653 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BgnP28653 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BgnP28653 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BgnP28653 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BgnP28653 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BgnP28653 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BgnP28653 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BgnP28653 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BgnP28653 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BgnP28653 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BgnP28653 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms