Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xrcc5P27641 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Xrcc5P27641 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Xrcc5P27641 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Xrcc5P27641 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Xrcc5P27641 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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Xrcc5P27641 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Xrcc5P27641 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Xrcc5P27641 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Xrcc5P27641 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xrcc5P27641 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xrcc5P27641 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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