Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tgfb2P27090 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfb2P27090 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb2P27090 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms