Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cdk11bP24788 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdk11bP24788 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk11bP24788 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms