Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ifrd1P19182 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ifrd1P19182 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms