Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd48P18181 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd48P18181 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd48P18181 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms