Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb1P17919 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms