Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ptbp1P17225 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms