Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkceP16054 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkceP16054 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkceP16054 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkceP16054 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkceP16054 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkceP16054 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms