Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dnmt1P13864 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Dnmt1P13864 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dnmt1P13864 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms