Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Vpreb1P13372 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vpreb1P13372 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms