Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scd2P13011 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd2P13011 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd2P13011 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms