Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cxcl1P12850 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cxcl1P12850 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms