Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApcsP12246 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApcsP12246 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ApcsP12246 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms