Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp1P12032 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timp1P12032 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Timp1P12032 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms