Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtcP11725 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtcP11725 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtcP11725 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OtcP11725 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtcP11725 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtcP11725 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtcP11725 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtcP11725 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtcP11725 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtcP11725 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtcP11725 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtcP11725 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtcP11725 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtcP11725 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtcP11725 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtcP11725 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtcP11725 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtcP11725 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtcP11725 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtcP11725 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtcP11725 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtcP11725 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtcP11725 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtcP11725 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtcP11725 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtcP11725 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OtcP11725 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OtcP11725 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtcP11725 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtcP11725 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtcP11725 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtcP11725 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtcP11725 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtcP11725 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms