Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa1P11477 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Defa1P11477 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Defa1P11477 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms