Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fv4P11370 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fv4P11370 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms