Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col1a1P11087 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a1P11087 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a1P11087 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms