Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UbbP0CG49 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms