Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Surf1P09925 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf1P09925 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Surf1P09925 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms