Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LtaP09225 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LtaP09225 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LtaP09225 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LtaP09225 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LtaP09225 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LtaP09225 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LtaP09225 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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LtaP09225 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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LtaP09225 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LtaP09225 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LtaP09225 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LtaP09225 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms