Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Saa1P05366 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Saa1P05366 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Saa1P05366 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms