Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-Eb1P04230 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-Eb1P04230 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms