Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01790 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01790 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01790 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01790 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01790 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01790 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01790 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01790 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01790 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01790 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01790 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01790 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01790 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01790 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01790 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01790 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01790 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01790 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01790 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01790 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01790 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01790 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms