Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mtatp6P00848 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtatp6P00848 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms