Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pde4aO89084 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pde4aO89084 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pde4aO89084 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms