Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cops3O88543 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops3O88543 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cops3O88543 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cops3O88543 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cops3O88543 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cops3O88543 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms