Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd200O54901 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd200O54901 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd200O54901 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms