Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Itgb3O54890 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms