Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atp10aO54827 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp10aO54827 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms