Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf9O35739 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf9O35739 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms