Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Abcc1O35379 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
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Abcc1O35379 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
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Abcc1O35379 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
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Abcc1O35379 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Abcc1O35379 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc1O35379 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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