Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh2d1bO35324 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh2d1bO35324 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d1bO35324 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d1bO35324 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d1bO35324 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d1bO35324 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d1bO35324 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d1bO35324 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sh2d1bO35324 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms