Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ebi3O35228 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ebi3O35228 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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