Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArxO35085 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArxO35085 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArxO35085 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArxO35085 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArxO35085 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArxO35085 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArxO35085 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ArxO35085 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArxO35085 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ArxO35085 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArxO35085 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArxO35085 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArxO35085 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ArxO35085 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ArxO35085 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ArxO35085 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArxO35085 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArxO35085 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArxO35085 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArxO35085 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArxO35085 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArxO35085 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArxO35085 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArxO35085 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArxO35085 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ArxO35085 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ArxO35085 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ArxO35085 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArxO35085 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArxO35085 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArxO35085 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArxO35085 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArxO35085 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArxO35085 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArxO35085 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ArxO35085 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ArxO35085 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArxO35085 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArxO35085 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArxO35085 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArxO35085 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArxO35085 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArxO35085 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArxO35085 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArxO35085 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ArxO35085 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ArxO35085 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ArxO35085 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ArxO35085 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArxO35085 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArxO35085 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArxO35085 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArxO35085 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArxO35085 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArxO35085 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArxO35085 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArxO35085 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ArxO35085 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms