Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nfil3O08750 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfil3O08750 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms