Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barx2O08686 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Barx2O08686 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Barx2O08686 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Barx2O08686 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Barx2O08686 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Barx2O08686 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Barx2O08686 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Barx2O08686 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Barx2O08686 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Barx2O08686 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Barx2O08686 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Barx2O08686 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Barx2O08686 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Barx2O08686 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Barx2O08686 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Barx2O08686 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Barx2O08686 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Barx2O08686 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Barx2O08686 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Barx2O08686 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Barx2O08686 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms